Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CSHL1Q14406 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms