Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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SCARB2Q14108 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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SCARB2Q14108 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SCARB2Q14108 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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