Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL9A3Q14050 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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