| MTMR3 | Q13615 | RNA5SP137-201 | ENST00000516833 | 135 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC090049.2-201 | ENST00000550377 | 109 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MIR4762-201 | ENST00000585261 | 75 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU1-58P-201 | ENST00000362413 | 163 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNORA1B-201 | ENST00000362535 | 133 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | U8.5-201 | ENST00000364528 | 136 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-1292P-201 | ENST00000383856 | 107 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNORD88.1-201 | ENST00000408684 | 91 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-659P-201 | ENST00000516454 | 104 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU7-28P-201 | ENST00000516759 | 62 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC007751.1-201 | ENST00000529260 | 376 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC091544.4-201 | ENST00000555268 | 342 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AL591926.4-201 | ENST00000616895 | 298 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | TDRD15-201 | ENST00000405799 | 6135 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | VSTM2A-OT1-201 | ENST00000456049 | 3031 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | TFEC-202 | ENST00000320239 | 6605 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZNF680-202 | ENST00000447137 | 2159 nt | TSL 2 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | PRKG1-205 | ENST00000401604 | 5922 nt | TSL 5 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC073325.2-201 | ENST00000339545 | 159 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MIR126-201 | ENST00000362291 | 85 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-862P-201 | ENST00000362804 | 105 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNORA33-201 | ENST00000363664 | 130 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNY1P11-201 | ENST00000363759 | 113 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | Y_RNA.261-201 | ENST00000364631 | 102 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AL603914.1-201 | ENST00000401964 | 204 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AL135790.1-201 | ENST00000427161 | 157 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | TRBV12-1-201 | ENST00000479785 | 344 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RN7SL297P-201 | ENST00000483161 | 293 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNORA18.4-201 | ENST00000516440 | 124 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC007318.2-201 | ENST00000620999 | 243 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CTSLP2-204 | ENST00000629029 | 392 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CHD9-218 | ENST00000566029 | 13110 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-888P-201 | ENST00000363010 | 101 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNORD18B-201 | ENST00000365659 | 72 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MIR522-201 | ENST00000385071 | 87 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC069257.2-201 | ENST00000441819 | 155 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AL353743.2-204 | ENST00000456242 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RN7SL20P-201 | ENST00000488827 | 297 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-237P-201 | ENST00000515985 | 71 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RN7SKP132-201 | ENST00000516001 | 208 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-1234P-201 | ENST00000516877 | 103 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MIR3126-201 | ENST00000577443 | 74 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MUM1L1-203 | ENST00000372552 | 3957 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZNF732-201 | ENST00000419098 | 2193 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | FAM46D-201 | ENST00000308293 | 3011 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MBNL3-205 | ENST00000370857 | 8760 nt | TSL 5 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNA5SP482-201 | ENST00000391269 | 118 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC099677.2-201 | ENST00000436385 | 175 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | UBBP3-201 | ENST00000445497 | 241 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | Y_RNA.712-201 | ENST00000517011 | 92 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | EYS-202 | ENST00000342421 | 2168 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | IL6ST-201 | ENST00000336909 | 8776 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | LCOR-205 | ENST00000421806 | 16004 nt | TSL 3 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZMYM1-201 | ENST00000359858 | 4175 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AGTPBP1-205 | ENST00000376083 | 4208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | Y_RNA.280-201 | ENST00000364765 | 112 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU1-148P-201 | ENST00000384472 | 162 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNORA12.1-201 | ENST00000390873 | 148 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MIR891A-201 | ENST00000401237 | 79 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MTATP6P21-201 | ENST00000440681 | 189 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | UBL5P3-201 | ENST00000475112 | 231 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC122707.1-201 | ENST00000502882 | 219 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SCGB1D5P-201 | ENST00000515134 | 247 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU1-104P-201 | ENST00000517280 | 175 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC007598.1-202 | ENST00000561528 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC069114.2-201 | ENST00000604699 | 304 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CACNB4-228 | ENST00000636598 | 7808 nt | TSL 5 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CEP57L1-213 | ENST00000520883 | 2055 nt | TSL 5 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | FGF14-201 | ENST00000376131 | 12882 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AL445259.1-201 | ENST00000587106 | 2984 nt | TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | LEPR-202 | ENST00000349533 | 8227 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNORA38-201 | ENST00000363946 | 132 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNORD56.5-201 | ENST00000364281 | 72 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | Y_RNA.353-201 | ENST00000365440 | 108 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-1336P-201 | ENST00000383886 | 109 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-851P-201 | ENST00000384565 | 107 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MIR181B1-201 | ENST00000385240 | 110 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | LINC00407-201 | ENST00000426509 | 295 nt | TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNRPGP13-201 | ENST00000442212 | 177 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AL035415.1-201 | ENST00000447150 | 289 nt | TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC108938.1-201 | ENST00000451204 | 136 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RN7SL499P-201 | ENST00000481141 | 276 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC110009.1-201 | ENST00000512965 | 451 nt | TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNA5SP76-201 | ENST00000516277 | 87 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC021785.1-201 | ENST00000520780 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC124657.1-201 | ENST00000527819 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | Hammerhead_HH9.1-201 | ENST00000616606 | 77 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | NEDD4-208 | ENST00000508342 | 7235 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MYSM1-208 | ENST00000622766 | 6020 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | U8.1-201 | ENST00000362843 | 134 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-1019P-201 | ENST00000364424 | 107 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNORD72-201 | ENST00000390994 | 80 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU7-26P-201 | ENST00000458980 | 63 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | Y_RNA.686-201 | ENST00000516548 | 134 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC107016.2-201 | ENST00000547968 | 190 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC004148.1-201 | ENST00000571506 | 398 nt | TSL 5 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC022513.1-201 | ENST00000624512 | 117 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | PIK3CA-201 | ENST00000263967 | 9093 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | HDX-206 | ENST00000506585 | 6158 nt | TSL 2 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| MTMR3 | Q13615 | Y_RNA.81-201 | ENST00000362997 | 102 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |