Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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TCIRG1Q13488 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TCIRG1Q13488 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TCIRG1Q13488 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TCIRG1Q13488 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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