Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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