Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ATMQ13315 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
ATMQ13315 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.6□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
ATMQ13315 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-1.6□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
ATMQ13315 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
ATMQ13315 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
ATMQ13315 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATMQ13315 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
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