Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CSTF3Q12996 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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