Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXA3O43365 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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