Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CTIFO43310 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CTIFO43310 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CTIFO43310 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTIFO43310 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTIFO43310 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CTIFO43310 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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