Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
NRXN1Q9ULB1 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.47□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.48□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
NRXN1Q9ULB1 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms