Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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RABGEF1Q9UJ41 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1Q9UJ41 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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