Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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