Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RBM42Q9BTD8 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RBM42Q9BTD8 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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