Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CTXN3Q4LDR2 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTXN3Q4LDR2 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTXN3Q4LDR2 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CTXN3Q4LDR2 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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