Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KNOP1Q1ED39 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KNOP1Q1ED39 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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