Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC142Q17RM4 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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