Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FAM187BQ17R55 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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FAM187BQ17R55 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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FAM187BQ17R55 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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FAM187BQ17R55 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FAM187BQ17R55 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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