Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RPE65Q16518 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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RPE65Q16518 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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RPE65Q16518 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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RPE65Q16518 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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RPE65Q16518 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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RPE65Q16518 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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