Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNGA3Q16281 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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CNGA3Q16281 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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CNGA3Q16281 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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CNGA3Q16281 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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CNGA3Q16281 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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CNGA3Q16281 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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CNGA3Q16281 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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CNGA3Q16281 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CNGA3Q16281 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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