Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ZFHX3Q15911 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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ZFHX3Q15911 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
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ZFHX3Q15911 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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ZFHX3Q15911 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
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ZFHX3Q15911 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
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ZFHX3Q15911 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
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ZFHX3Q15911 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ZFHX3Q15911 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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