Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
NEDD8Q15843 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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