Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
HMGN3Q15651 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
HMGN3Q15651 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
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