Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NECTIN1Q15223 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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