Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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BRD3Q15059 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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BRD3Q15059 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
BRD3Q15059 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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BRD3Q15059 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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BRD3Q15059 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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BRD3Q15059 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
BRD3Q15059 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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