Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
R3HDM1Q15032 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
R3HDM1Q15032 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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