Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CAPRIN1Q14444 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms