Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CDK13Q14004 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CDK13Q14004 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms