Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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PKP1Q13835 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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PKP1Q13835 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PKP1Q13835 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PKP1Q13835 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PKP1Q13835 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PKP1Q13835 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
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PKP1Q13835 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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PKP1Q13835 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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PKP1Q13835 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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PKP1Q13835 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PKP1Q13835 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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