Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TUBA3CQ13748 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUBA3CQ13748 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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