Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HTR4Q13639 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HTR4Q13639 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HTR4Q13639 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HTR4Q13639 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HTR4Q13639 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HTR4Q13639 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HTR4Q13639 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HTR4Q13639 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
HTR4Q13639 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms