Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HDAC1Q13547 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms