Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LSAMPQ13449 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LSAMPQ13449 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LSAMPQ13449 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LSAMPQ13449 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LSAMPQ13449 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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