Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
TCOF1Q13428 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TCOF1Q13428 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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