Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MRPL49Q13405 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MRPL49Q13405 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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