Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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IFT88Q13099 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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IFT88Q13099 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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