Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KCNMA1Q12791 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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KCNMA1Q12791 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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KCNMA1Q12791 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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KCNMA1Q12791 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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KCNMA1Q12791 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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KCNMA1Q12791 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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KCNMA1Q12791 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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KCNMA1Q12791 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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KCNMA1Q12791 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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KCNMA1Q12791 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KCNMA1Q12791 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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