Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXO1Q12778 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXO1Q12778 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms