Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RBBP4Q09028 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RBBP4Q09028 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms