Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXC5Q00444 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
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HOXC5Q00444 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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