Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
VAMP4O75379 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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VAMP4O75379 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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VAMP4O75379 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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VAMP4O75379 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAMP4O75379 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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