Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HOXA3O43365 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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