Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRDMT1O14717 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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