Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
CIPCQ9C0C6 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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