Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN4Q92575 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN4Q92575 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN4Q92575 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
UBXN4Q92575 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBXN4Q92575 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBXN4Q92575 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBXN4Q92575 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBXN4Q92575 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBXN4Q92575 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBXN4Q92575 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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