Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP43Q70EL4 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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