Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ZBED9Q6R2W3 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED9Q6R2W3 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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