Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LONRF1Q17RB8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LONRF1Q17RB8 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 703.7 ms