Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
RTL8BQ17RB0 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.5 ms