Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPN21Q16825 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
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